ต้านเชื้อแบคทีเรียมะละกอบดยังดีต่อการรักษาบาดแผลที่ผิวหนังและมีฤทธิ์ต้านเชื้อแบคทีเรีย เนื่องจากปาเปนและไคโมปาเปน ประโยชน์ของมะละกอ สามารถใช้เป็นแผ่นปิดผิวหนังสำหรับแผลไหม้ภายใต้สภาวะที่สะอาด และขี้ผึ้งที่มีปาเปนจะมีประโยชน์ในการรักษาแผลที่ผิวหนังขาดเลือด สุขภาพผิวหนังและเส้นขนมะละกอยังเป็นที่รู้จักกันว่าช่วยเพิ่มสุขภาพเส้นผม เนื่องจากมีปริมาณวิตามินเอ